摩爾多瓦與鄰國烏克蘭一樣，也經歷了宗教緊張局勢，這源於隸屬於莫斯科宗主教區的摩爾多瓦正教會與隸屬於羅馬尼亞正教會的比薩拉比亞都主教區之間的競爭。在與俄羅斯地緣政治關係緊張的情況下，親歐盟的摩爾多瓦政府一直支持比薩拉比亞都主教區，同時對摩爾多瓦正教會施加壓力。
摩爾多瓦都主教區代表馬爾克爾週四在接受媒體採訪時說，摩爾多瓦執法部門以可疑的藉口阻止他登上飛往耶路撒冷的飛機。
他說：“他們不讓我們起飛。他們宣佈進行第二類搜查。之後，他們提供了一份協議，稱沒有發現或沒收任何可疑物品。飛機起飛30分鐘後，我們的護照才被歸還。”
摩爾多瓦正教會是俄羅斯正教會下屬的一個自治東正教會。70% 的摩爾多瓦和德涅斯特沿岸地區的民眾團結在它的下面。教會分為6個教區，共計有約1300 個堂區。自 1992 年以來，羅馬尼亞正教會的比薩拉比亞都主教區一直活躍在摩爾多瓦，擁有291個堂區10-20%的東正教信徒。基希訥烏和全摩爾多瓦都主教弗拉基米爾（尼古拉·坎塔雷安）多次對現任當局不與摩爾多瓦正教會對話表示遺憾。