馬英九參加華僑救國聯合總會第72屆華僑節大會致詞時表示，民進黨對“中華民國”的態度，讓人感覺到有一點憂心。在馬英九要離開會場時，被媒體問到憂心甚麼，他表示，“擔心他們借殼上市，他們支持中華民國的話，就要支持中華民國的兩岸立場”。
賴清德在5月20日發表就職演說時提出被稱為“新兩國論”的兩岸論述，稱“中華民國與中華人民共和國互不隸屬”。10月5日，“雙十節”前夕，又拋出“祖國說”，稱中華人民共和國絕不可能成為中華民國人民的“祖國”。10月10日，馬英九因不滿賴清德主張“新兩國論”，拒絕出席“雙十”慶典。他認為賴清德已成為不折不扣的麻煩製造者，呼籲其懸崖勒馬，放棄荒謬的“新兩國論”，不要為了個人錯誤的意識形態，再讓全體台灣人民陷入險境。
國台辦發言人表示，台灣前途在於國家統一，台灣同胞福祉繫於民族復興。不管賴清德講甚麼，都改變不了台灣是中國一部分的法律地位和兩岸同屬一個中國的事實與現狀。我們有信心和能力實現祖國完全統一，任何人、任何勢力都阻擋不了民族復興、國家統一的歷史大勢。