據台灣“中時新聞網”報道，馬英九指出，台灣跟大陸彼此之間並不是兩個國家，而是兩個地區，可以相互和平共處。他在任內於2015年與中國國家主席習近平在新加坡會面，兩岸也簽署了23個協議。但是賴清德現在提出“新兩國論”，引發台海緊張，全球嚴重關切，他已經成為一個不折不扣的麻煩製造者。
馬英九呼籲賴清德，立即冷靜下心來，懸崖勒馬，以全體台灣人民的幸福為念，放棄荒謬的“新兩國論”，不要為了個人錯誤的意識形態，再讓全體台灣人民陷入險境。
中國國務院台辦發言人朱鳳蓮10月8日就賴清德言論回應稱，賴清德的說法偷換概念、混淆是非，通過突出兩岸政治分歧、蓄意割裂兩岸歷史聯結，繼續兜售其“中華民國與中華人民共和國互不隸屬”的“新兩國論”，鉗制台灣同胞的國家認同、民族認同。賴清德新瓶裝舊酒的“台獨”謬論，再次暴露其冥頑不化的“台獨”立場和升高敵意對抗的險惡用心。