協商結束後，晉江紅十字會高級顧問李朝暉表示，“2·14”撞船事件發生至今已5個多月，雙方善後協商終於達成共識。希望台灣有關方面認真落實協商紀要條款，讓遇難者安息，給家屬一個交代。
上午10時20分許，遇難者家屬、兩岸代表人士約百人在金門殯葬管理所舉行聯合致祭告別式。15時20分許，家屬在晉江紅十字會人員陪同下乘船返回。
台海巡部門負責人張忠龍在祭奠現場向家屬表示：“對於家屬所受的煎熬，願意再次公開表達歉意，請家屬節哀。”
在金門水頭碼頭，李朝暉受訪表示，兩名遇難者終於能返回故鄉，家屬也等來了遲到的道歉。希望台有關方面盡快公佈事件真相，做出公正的調查結論，並對涉事人員作出相應處理。他說：“兩岸本就一家人，晉江與金門一水之隔，更是親上加親。台有關部門理應善待大陸漁民，確保今後不再發生此類傷害兩岸同胞感情、破壞兩岸關係的惡性事件”。
另據台媒消息，30日晚間，針對“這次兩岸就此事的協商是當事人對當事人，這是否能成為兩岸協商新模式”的問題，國台辦新聞發言人陳斌華表示表示，紅十字會工作人員受家屬委託與台灣方面就“2．14”撞船事件進行溝通，“與兩岸協商談判無關”。兩岸制度化協商機制停擺的原因眾所周知，只有回到“九二共識”政治基礎，兩岸協商談判才能恢復。
今年2月14日，福建一艘漁船在金門海域被台方海巡艦艇追撞，致船上4人全部落海，其中2人遇難。