2014年7月17日，阿姆斯特丹飛往吉隆坡的航班號為MH17的波音777客機在烏克蘭頓涅茨克州上空墜毀，機上298人全部遇難。基輔把空難的責任歸咎於頓涅茨克人民共和國民兵，民兵則稱他們沒有能在這個高度擊落飛機的武器。
佩斯科夫向記者稱：“我方的立場是眾所周知的。俄羅斯方面的任何論據都沒有被考慮在內。我方沒有參與調查，因此我們對這些結論的態度是眾所周知的。”
2022年11月17日，海牙區法院裁定俄羅斯人伊戈爾∙吉爾金、謝爾蓋∙杜賓斯基和烏克蘭人列昂尼德∙哈爾琴科對2014年在烏克蘭東部MH17航班墜毀和298名乘客死亡案上有罪，並缺席判處其無期徒刑。同時海牙區法院認定第四名被告俄羅斯人奧列格∙普拉托夫無罪，並駁回檢方將其監禁的要求。普拉托夫被免除賠償訴訟責任。據荷蘭法院裁決，其餘人應向受害者家屬支付總額為1600萬歐元的賠償金。法院在判決過程中沒有將對MH17航班使用“山毛櫸”防空導彈系統與俄羅斯直接相關，儘管法院也認為俄羅斯當時對頓涅茨克人民共和國有控制力。
俄外交部從一開始就表示，對俄羅斯參與波音墜機事件的指控毫無根據和令人遺憾，而調查具有偏見和片面性。據俄外長拉夫羅夫稱，調查充滿了雙重標準。