然而，政府的樂觀態度並沒有得到所有人的贊同，科學家、漁民、公共組織及鄰國都表示決策過程不透明，沒有考慮利益相關方的意見。
甚至日本國內也沒有達成共識
自從日本政府有關將淨化過的核污水排放到海洋的計劃公開的那刻起，各社會組織就呼籲反對將核廢水排放到海洋里，而應考慮並研究出其他方法，比如通過選擇更多能存放裝有核污水儲液罐的地方來解決。還有儘管國際原子能機構事先發佈了有關日本核污水排海符合國際安全標準，但日本原子力市民委員會在其“8月23日發佈的緊急聲明”中繼續堅持“ALPS”淨化核污水方法是無效的且排放過程很漫長，關於這一點，福島第一核電站運營商東京電力公司稱，整個排放過程可能需要30多年。這一機構還稱，這種不環保的排放所需成本高得不合理，總計達1200億日元，成本包括淨化核污水、建造水下排放通道及為輓回聲譽和支持漁業的費用。
除此之外，漁民們認為，即使是花錢打擊那些對在日本近海捕獲的海鮮產品進行“投機買賣”的行為可能也是不夠的，賠償並不能解決問題，政府和東京電力公司必須盡一切努力傳播有關產品安全的信息。
鄰國的擔憂
中國、韓國和俄羅斯從一開始就向日本表達了對排放核污水的擔憂。日本政府主要因未經適當協商自行做出這樣的決定而受到各鄰國指責。8 月初，中國外交部表示，這些國家已經向日方發出了技術問題單。
目前，中國已全面禁止進口福島產品，韓國和台灣也已對其實施部分禁令。