7月7日，中國海關總署進出口食品安全局負責人表示，為防範受到放射性污染的日本食品輸華，保護中國消費者進口食品安全，中國海關禁止進口日本福島等十個縣（都）食品，對來自日本其他地區的食品特別是水產品（含食用水生動物）嚴格審核隨附證明文件，強化監管，嚴格實施100%查驗，持續加強對放射性物質的檢測監測力度，確保日本輸華食品安全，嚴防存在風險的產品輸入。
日本內閣官房長官松野博一7月21日在內閣會議後舉行的記者會上說，“如果全面引進放射線檢查的話，這將與放寬和取消日本食品進口限制的國際動向背道而馳，我對此深表擔憂。日本政府將繼續根據國際原子能機構報告的結論，向國際社會詳細說明。”
他還表示，日本產食品原本就被科學地證明其安全性。此前，在首腦、外相層面，以科學為根據，要求中國方面解除進口限制措施。今後，政府也將通過各種機會對此進行強力推動。
針對日本水產品在中國海關停留時間變長導致出口停滯，日本農林水產大臣野村哲郎21日表示，政府正在確認詳細情況，並將強烈推動中國不進一步強化限制措施。
中國海關總署稱，當前，日本核污染水排海問題已成全球關注焦點，也引起中國消費者對自日本進口食品安全的擔憂。中國海關將保持高度警惕，以對國內消費者絕對負責為原則，視事態發展及時採取一切必要措施，確保中國消費者餐桌上的安全。
中國外交部發言人毛寧7月20日在例行記者會上表示，中國政府秉持以人民為中心的施政理念，我們必須對人民的健康和海洋環境負責，反對日方的排海計劃有理有據，採取有關措施有理有據。
毛寧指出，中方敦促日方認真傾聽國際社會的呼聲，停止強推核污染水排海計劃，以真誠的態度同周邊鄰國進行充分協商，以負責任的方式處置核污染水，並接受嚴格的國際監督。