9月16日上午，吉爾吉斯斯坦和塔吉克斯坦在邊境地區開始大規模武裝衝突。雙方均指責對方開火。兩國軍隊沿兩國邊界全線的激烈戰鬥持續幾乎一整天。17日早上，雙方再度指責對方開火。開火直到傍晚才停止。吉爾吉斯斯坦聲稱，這場衝突導致36名吉國公民死亡、134人受傷。