8月20日晚，在莫斯科州奧金佐沃區莫扎伊斯基公路上，一輛汽車爆炸導致杜金娜身亡。俄聯邦安全局8月22日宣佈，杜金娜被害案的幕後黑手是烏克蘭情報部門，執行人為烏克蘭公民娜塔莉婭•沃夫克，她於7月23日攜女兒來到俄羅斯。據聯邦安全局信息，在汽車被遙控爆炸後，謀殺執行人攜女兒經普斯科夫州前往愛沙尼亞。
杜金在俄羅斯“第一頻道”播放的影片片段中回答了主持人“殺手為何要殺他女兒”的問題。
杜金稱：“（杜金娜的死）是為了俄羅斯的理念，為了宗教理念，為了東正教的理念，為了主權理念，為了保護我們的人民、我們的國家。”
這位哲學家指出，兇手的目標正是達麗婭•杜金娜，不是他。
杜金補充稱，“一切都是為了殺死她，原則上，兇手沒有失手，殺死了她”。