據共同社報道，山上徹也的父親1984年自殺後，他的母親加入宗教組織“統一教”，用變賣土地和房產的錢及丈夫死後的保險賠償金向該組織捐款1億日元（按當時的匯率這一數目接近100萬美元）。2002年初，其母宣佈破產。
山上徹也的伯父稱，山上徹也認為母親的捐款行為和之後的破產毀了他的家庭和未來——他沒上成大學。後來，他報名加入日本海上自衛隊，在2005年服役期間曾試圖自殺，想將保險金留給他的哥哥和妹妹。
山上徹也向警方招認，他對“統一教”懷有恨意已經20年，在刺殺安倍的前一天，他朝奈良市一棟與該宗教組織有關的建築開了槍。山上徹也此前稱，認為安倍晉三與“統一教”有關，因為安倍去年曾向與該教會友好的一個組織致以問候。山上徹也還說，安倍晉三的外祖父——日本前首相岸信介似乎促成了該宗教組織進入日本。