扎哈羅夫說：“軍事政變是破壞國家的穩定。目前還不清楚上台的軍政府代表哪些力量。俄羅斯與蘇丹的關係將如何進一步發展，關於俄羅斯海軍基地達成的協議如何履行，也不清楚。我們希望一切都重回正軌，蘇丹再次沿著和平發展的道路前進。”
10月25日早上，蘇丹軍方拘押了總理哈姆多克和其他幾名政府成員。蘇丹過渡主權委員會主席阿卜杜勒·法塔赫·布爾汗在向全國發表電視講話時宣佈實行緊急狀態並解散委員會和該國政府。26日獲悉，哈姆多克及其夫人已返回首都住所。
2020年11月，俄羅斯和蘇丹就在蘇丹境內建設俄海軍物資保障點達成協議。根據文件，在保障點駐紮的俄軍人數不能超過300人，同一時間停泊的俄軍艦船不超過4艘。
2021年9月，蘇丹軍事部門的一位知情人士告訴衛星通訊社，蘇丹認為有必要修改關於在紅海沿岸的蘇丹港建立俄羅斯海軍基地的協議，以便在租賃五年並可能簽訂為期 25 年的協議的情況下從俄羅斯獲得經濟援助。蘇丹大使館向衛星通訊社承諾，該國不會要求俄羅斯支付任何款項，有關此事的報道“毫無根據”。