新冠病毒的基因組由近30000個RNA鹼基組成。此前科學家已經根據與相關病毒中蛋白質編碼基因的相似性，確定了一些能編碼蛋白質的基因。他們認為，另外還有些基因能編碼蛋白質，但它們並沒有明確歸類為蛋白質編碼基因。
為確定這些蛋白質編碼基因，計算機科學和人工智能實驗室的瑪諾里斯∙克里斯教授領導的實驗團隊利用自己開發出的計算技術，對新冠病毒、薩斯病毒和42株蝙蝠沙貝病毒亞屬進行了分析。這一技術的基本原理是分析物種之間是否保存著某些DNA或RNA鹼基，並比較它們隨時間如何進化，他們此前已利用該技術比較了人類基因組與其它哺乳動物的基因組。
結果表明，除發現此前已在其他冠狀病毒中發現的5個基因外，克里斯團隊還確認了新冠病毒基因組中6個蛋白質編碼基因，而其他5個被認為能編碼蛋白的基因並無此能力。他們表示，在分析了整個基因組後，非常確信沒有其他蛋白質編碼基因成為“漏網之魚”。他們計劃繼續開展實驗研究，以弄清這些沒有特徵基因的功能。
此外，克里斯團隊還分析了自新冠病毒首次被發現以來，已經出現的1800多個突變，並比較了每個基因在過去的進化速度和疫情暴發以來的進化速度。結果表明，大多數情況下，在疫情暴發之前長時間快速進化的基因仍在繼續快速進化，而緩慢進化的基因也保持著自身的節奏。不過也有例外，這可能有助於揭示病毒在適應新的人類宿主時是如何進化的。
研究人員還分析了幾種新冠病毒變異毒株——B.1.1.7、P.1和B.1.351等出現的突變。結果發現，許多使這些變異更危險的突變存在於刺突蛋白中，有助於病毒更快地傳播並避開免疫系統。他們指出，每個變異毒株都擁有20多個獨特的突變，知道哪些可能有用，哪些無用非常重要，有助於科學家專注最有可能對病毒傳染性產生重大影響的突變。
此外，克里斯團隊還分析了自新冠病毒首次被發現以來，已經出現的1800多個突變，並比較了每個基因在過去的進化速度和疫情暴發以來的進化速度。結果表明，大多數情況下，在疫情暴發之前長時間快速進化的基因仍在繼續快速進化，而緩慢進化的基因也保持著自身的節奏。不過也有例外，這可能有助於揭示病毒在適應新的人類宿主時是如何進化的。
研究人員還分析了幾種新冠病毒變異毒株——B.1.1.7、P.1和B.1.351等出現的突變。結果發現，許多使這些變異更危險的突變存在於刺突蛋白中，有助於病毒更快地傳播並避開免疫系統。他們指出，每個變異毒株都擁有20多個獨特的突變，知道哪些可能有用，哪些無用非常重要，有助於科學家專注最有可能對病毒傳染性產生重大影響的突變。