聯合國法外處決、即審即決或任意處決問題特別報告員卡拉馬爾以及促進和保護意見和表達自由權特別報告員艾琳·汗在此前發給俄羅斯政府的正式信函中表示，“俄羅斯當局向德國、法國、瑞典三國相關部門負責人發出六封正式信函，請求各方予以協助，其中包括以訪談形式詢問阿列克謝·納瓦利內、負責納瓦利內在德治療的醫生以及納瓦利內在德陪同人員。目前，（三國）授權官員看來是拒絕進行合作”。
納瓦利內於2020年8月22日至2021年1月17日在德國逗留期間，作為德國總理默克爾的私人客人，他受到德國安全部門的保護。 2020年8月22日至9月23日，在柏林夏里特醫院（Charite）接受治療期間，納瓦利內受到在醫院周邊值班的警察的保護。柏林警方和德國內政部證實了這一消息。據媒體報道，特工部門人員還在他所在樓層的病房附近值班。
1月17日離開德國那一天，納瓦利內和他的妻子尤莉亞被帶閃光燈的汽車直接帶到飛機登機梯旁。據媒體報道，這對夫妻的飛行登記由德國警方人士辦理。
2020年8月20日，俄反對派人士阿列克謝∙納瓦利內在托木斯克至莫斯科的航班上出現不適，飛機在鄂木斯克緊急降落後他被送往當地醫院。鄂木斯克醫院方面稱在納瓦利內的血液和尿液中均未發現有毒物質。納瓦利內的家人爭取到俄當局允許後用專機把他送到德國夏里特醫院治療。德國聯邦國防軍實驗室，以及瑞典、法國等多個獨立歐洲實驗室宣佈從納瓦利內的化驗樣本發現諾維喬克類毒劑的痕跡。
2021年1月17日，納瓦利內在德國治療後返回俄羅斯，在莫斯科謝列梅捷沃機場入境時被拘留。俄聯邦懲罰執行局表示，由於納瓦利內在緩刑考察期內多次違反緩刑規定，法院應就緩刑改實刑的問題作出裁決。法院次日批准逮捕納瓦利內。2月2日，莫斯科西莫諾夫斯基法院將納瓦利內的緩刑改判實刑，判處他3年半監禁。將被軟禁的時間折合為刑期後，納瓦利內將實際服刑2年零8個月。納瓦利內有兩起經濟犯罪案件的緩刑案底，但他宣稱自己無罪，認為受到政治迫害。
美國、德國、法國和英國等西方國家呼籲俄羅斯當局釋放納瓦利內。俄羅斯外交部就此發表評論時，建議外國政治家尊重國際法，專注於解決自己國家的問題。