衛生部消息中稱，“免費疫苗接種將自願進行，涉及17歲及以上年齡公民，疫苗將不面向兒童。預計此過程將分為三個階段。第一階段將為65歲及以上公民，以及慢性病患者、醫務工作者（包括牙科醫生和急救人員）、藥房和社會服務工作者接種疫苗。”
第二階段將為消防人員、軍人、教師、政府和抗擊新冠病毒疫情危機總部（全國到地區）人員、電力工作人員和國家公務員接種疫苗。
第三階段將可以為所有其餘未列入以上專業列表中的公民接種疫苗。
每人將分兩次接種疫苗，兩次之間間隔28-30天。
衛生部已在2021年1月至12月按月安排接種疫苗公民人數。預計接種最多的是4月至9月。在此期間，總共可為504萬人（捷克人口為1069萬人）接種疫苗。