他對記者稱：“至於提及天然氣管道，則可能需要在任何政治化背景下停止提及。這是一個商業項目，其完全符合俄羅斯和歐盟國家（主要是德國）的利益。”
佩斯科夫在評論歐盟委員會主席的說法稱俄羅斯在與納瓦利內有關情況中的行為是典型的時指出：“我們堅決不同意這一說法。首先，柏林病人所發生的事情需要查清，需要調查和查清。為了推進這項調查並查清情況和原因，首先與德國的合作很有必要。俄羅斯正尋求這一合作，但尚未得到對等回應。”
此前德國一系列政治人士就納瓦利內事件主張停止建造“北溪-2”號項目，其它西方國家也呼籲對俄羅斯實施制裁。德國總理默克爾表示，應該分開審議“北溪-2”項目和納瓦利內事件。
8月20日，俄反腐基金會創始人納瓦利內在托木斯克至莫斯科的航班上出現不適，飛機在鄂木斯克緊急降落後被送往當地醫院。俄反腐基金會新聞秘書亞爾梅什稱，納瓦利內在航班起飛前曾在機場的咖啡店喝過茶，認為他可能是中毒。鄂木斯克醫院方面給出的主要診斷是血糖急劇下降引起的代謝紊亂，指出其血液和尿液中均未發現有毒物質。
8月22日，德國醫療隊把處於昏迷狀態的納瓦利內用飛機運往柏林夏里特醫院。
8月24日，夏里特醫院作出膽鹼酯酶抑制劑類物質中毒的初步診斷。德國政府9月2日發表聲明稱，德國聯邦國防軍實驗室確定納瓦利內是諾維喬克類毒劑中毒。俄總檢察院此前向德方提出過就納瓦利內事件提供法律援助和調查的請求，德方表示將及時反饋。
俄羅斯總統新聞秘書佩斯科夫9月4日在回答記者提問時說，有關納瓦利內情況的偵查行動已經展開，如果確認是中毒，也將進行正式調查。
柏林夏里特醫院9月7日發佈消息稱，納瓦利內的狀況好轉，他已從昏迷中醒來。