報道稱，納瓦利內喝過水的瓶子是其家屬交給柏林醫院方面的，據信他從瓶中喝水時，有毒物質已經進入血液。
報道指出，進行檢驗的是位於慕尼黑的德國聯邦國防軍藥理學和毒理學研究所。
8月20日，俄反腐基金會創始人納瓦利內在托木斯克至莫斯科的航班上身體出現不適，飛機在鄂木斯克緊急降落後，他被送往當地醫院。俄反腐基金會新聞秘書亞爾梅什認為納瓦利內可能中毒，稱他在航班起飛前曾在機場的咖啡店喝過茶。鄂木斯克醫院方面給出的主要診斷是血糖急劇下降引起的代謝紊亂，指出在他的血液和尿液中均未發現有毒物質。8月22日，德國醫療隊把處於昏迷狀態的納瓦利內用飛機運往柏林夏里特醫院。8月24日，夏里特醫院作出膽鹼酯酶抑制劑類物質中毒的初步診斷。德國政府9月2日發表聲明稱，德國聯邦國防軍實驗室確定納瓦利內為諾維喬克類毒劑中毒。