美國貝勒醫學院的
專家們進行了由34人參加的一項研究，在研究中抽取了從大腸不同部位粘膜的活體組織切片。然後科學家們把喝咖啡多（多於82.9毫克）的人和喝咖啡少的人的
腸道各種細菌的分布量進行了對比。
科學家們發現，喝咖啡多的第一組人有更多些的普拉梭菌（Faecalibacterium）和羅斯氏菌（Roseburia）這樣“友好”的抗炎
細菌，有害細菌Erysipelatoclostridium則少些。
研究者們指出，腸道微生物的這種組成成分和結構在降低心血管疾病、糖尿病和肝病方面起著重要作用。