馬來西亞交通部長陸兆福在國會中說，新加坡開始在實里達新機場安裝導航設備。機場將接納渦輪螺旋槳飛機和商用噴氣式飛機。機場定位導航系統發出的無線電信號將干擾馬來西亞船隻在柔佛港水域的航行--水域上空有要降落的飛機穿越。除此之外，新加坡飛機的飛行軌道限制了馬來西亞境內新建樓房的高度，並造成噪音污染。
新加坡方面回應馬來西亞交通部長時表示，自己"尊重馬來西亞的主權"。但它同時對馬方打算擴大新山港口水域邊界表示嚴重關切。新加坡認為，這將是馬來西亞對新加坡大士島周邊領海主權的侵犯。新加坡交通部長許文遠向記者表示，最近兩周馬方船隻不止一次侵入該水域。新加坡對這些未經批准、公然侵犯本國主權、違背國際法的行動表示抗議。
新加坡方面認為，這些行動不利於良好的雙邊關係，給國際航運造成混亂，導致各方航行和安全風險增加。新加坡交通部長指出，"新加坡願意根據國際法與馬來西亞配合，以友好方式解決這些問題"。
俄羅斯科學院東方研究所專家阿列克謝·德魯戈夫認為，東盟或許是解決這個問題的平台之一。
他說："這兩個國家間一直存在著某種緊張。尤其是在馬哈蒂爾上台後，馬來西亞開始提醒新加坡，它靠著它的水管生存。新加坡不可能從其他地方獲得飲用水。出現了水價摩擦。兩國間的緊張將來也會一直存在下去，但我認為，鄰里關係注定會讓它們尋找可被雙方接受的解決方案。我暫時到不誇張目前出現的這種海空域利益衝突。緊張會緩解，兩國會在東盟框架內解決這個問題。不久前在新加坡召開的東盟峰會證明，這個平台對解決雙邊與地區問題是有效的。此外，新加坡是全球範圍的重要參與者，它是世界銀行與經濟中心，是最大的港口。任何同鄰國出現的問題，都自然會影響它的形象，有損其利益。"
中國國際問題研究院南太平洋研究所研究員沈世順認為，問題會通過外交途徑得到解決。
沈世順說："新加坡和馬來西亞歷史上本是一家，就像一個大家庭中的兩個兄弟分了家，獨立成為兩個國家，雙方在一些海域、空域的邊界劃分的劃分上難免存在界限模糊的問題。儘管目前新馬雙方都在相互指責，一方稱對方侵犯了自己的領空，一方稱對方侵犯了自己的領海。但是我認為，這個問題不至於會使兩國關係惡化，目前的衝突和指責仍在一個可控的範圍之內，完全可以通過外交、談判途徑，按照國際法原則解決。我相信，新馬兩國是一對成熟、理智的兄弟，也都是遵守法紀的國家，不會亂來，現在遠沒有到對話渠道關閉，衝突不可控的局面。"
然而觀察家們注意到，新馬雙方未能利用最新一次東盟峰會這個平台就供給新加坡飲用水價格問題進行談判，儘管曾計劃這樣做。馬來西亞是新加坡唯一飲用水供應商。1962年兩國簽署了相應協議，其有效期截至2061年。
觀察家們就此提醒說，在馬哈蒂爾上次1981-2003年執政期間馬新兩國就因海空邊界問題發生過嚴重爭吵。例如，1998年時任總理的馬哈蒂爾因噪音和污染針對新加坡軍機關閉了本國的領空。再早些時候，1980年兩國因面積雖小於足球場但具有重要戰略意義的無人島白礁島主權歸屬問題發生過衝突。爭執在馬哈蒂爾執政期間一直沒有停止。只是到了2008年聯合國國際法庭才解決了這個邊界問題--判決有利於新加坡。
察哈爾學會高級研究員、廣西民族大學中國-東盟海上安全研究中心主任葛紅亮認為，現在出現的這種衝突無需外部仲裁。
葛紅亮說："我個人認為，新馬兩國因這一事件交惡的可能性不大，這主要是兩國政策對接的問題所致。馬來西亞新盟政府執政以來，新馬之間已經在水資源、新隆高鐵等領域有多個回合的外交口水戰與政策交鋒，但相關問題也並未衝擊兩國關係。因而，我相信，新馬兩國領導和政策部門會就此展開對話、溝通與磋商解決問題。"
目前新馬有關海空域劃分出現的分歧，同馬來西亞圍繞一馬發展公司（1MDB）的腐敗醜聞有關的微妙問題相互交織。馬來西亞知名新聞網站The Coverage發佈一條消息，似乎馬來西亞前總理納吉布同新加坡總理李顯龍之間存在不正當交易，後者保證新加坡銀行支持一馬發展公司。接著此條消息被新加坡社交網絡轉發。新加坡總理李顯龍以誹謗為由起訴。然而馬來西亞媒體公佈有關他牽扯入金融醜聞的消息，顯然無助於鞏固新馬兩國關係。