巴西聖保羅大學學者費南達·阿爾梅達（Fernanda Almeida）稱："我們發現，在食物和人體內都有大量對不同抗生素具有耐藥性的沙門氏菌菌株，這說明現在巴西因受感染食品爆發流行病的風險非常高。"
近年來，醫藥專家越來越經常碰到的一個棘手問題就是"超級細菌"，即對一種或多種抗生素具有耐藥性的微生物，其中即包括稀有病原體，也包括一些非常常見和危險的病原體，比如金黃色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 和克雷白氏肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)。存在這樣的現實風險，即所有抗生素都會失去效力，醫學將回到"黑暗時代"。
科學家們認為，最容易滋生這些微生物的地方是醫院和抗生素用於加快肉畜生長的農場，醫院和農場都既有大量潛在病毒攜帶者，又有細菌和迫使細菌進化的抗生素，並且在抗生素的幫助下，"普通細菌"無法排擠掉繁殖能力較弱的超級細菌。
近年來，世界各國都經常爆出進口牛肉及其他肉類中含有大量危險病原體的醜聞，其中就包括沙門氏菌。
沙門氏菌在1982年至2013年間曾造成巴西發生集體腹瀉和發燒，沙門氏菌90種基因組已被破譯。然而阿爾梅達和她的同事發現，過半沙門氏菌菌株已對一種或多種抗生素具有耐藥性。
這一分析表明，沙門氏菌後來又迅速發展出40多種基因，能使它對某一種或好幾種抗生素免疫。其中部分基因是它們自主獲得的，另一些則可能是從其他危險細菌那裡"借"來的，因為它們的結構與肺炎球菌DNA片段具有相似性。
目前，超過一半的巴西沙門氏菌菌株已不受磺胺類藥物和鏈霉毒影響，還有三分之一對四環素和慶大霉素沒有反應，7%開始對抗被稱為"抗生素最後希望"的頭孢菌素的作用。
近幾十年來，大多數新感染並不是由鼠傷寒沙門菌類的"超級細菌"引起的，而是由腸炎沙門氏菌變種或上世紀90年代從歐洲流入巴西的沙門氏菌變種造成。
科學家還不知道其中的原因。與此同時，他們強調，難以殺滅的沙門氏菌隨時可能重現並導致集體感染，對抗這種沙門氏菌將極為困難。