俄國防部指出，以色列飛機故意在拉塔基亞地區製造危險局勢，以色列空中管制系統不可能沒發現俄羅斯伊爾-20飛機，因為後者正在下降，準備著陸。俄國防部表示，以色列在發動打擊前一分鐘才通過熱線將行動計劃告知俄方，此時已經沒有時間將伊爾-20飛機引導至安全區域。俄國防部認為以方的挑釁行為是敵對的。
9月18日，以色列總理內塔尼亞胡通電話就伊爾-20偵察機被擊落導致俄軍人喪生的事件向俄羅斯總統普京表示哀悼，並稱敘利亞方面對飛機墜毀負責。他補充道，以色列願意向俄羅斯提供為調查該事件所需要的信息。
9月20日，以色列空軍司令阿米卡姆·諾金率以軍事代表團訪問莫斯科，努力證明以色列與這起悲劇無關。據以軍高級代表稱，代表團帶來的情報顯示，以軍飛機已經返回基地準備降落時，敘利亞方面又發射了20多枚防空導彈。
瑙姆金不認可以色列方面的結論。
瑙姆金在接受衛星通訊社的採訪時指出：“以色列人起飛去轟炸拉塔基亞地區，打擊目標就在俄軍駐地附近。”他說：“他們如何能深入敘利亞國境實施轟炸，明知這會對我國的空天軍構成危險？在他們飛到之前1分鐘才接到警告。這與兩國的合作水平不符。”
他指出：“我國為以色列做出了很多，也一向考慮到以色列的利益，從蘇聯時期就是如此，就連還沒有兩國當今的正常關係、緊密合作與夥伴關係時就是如此。我不明白，為甚麼要尋釁破壞兩國間今天的友誼呢？”
瑙姆金回顧說，今年7月，應以色列的要求，敘利亞境內的伊朗部隊從戈蘭高地與以軍的接觸線處後撤了至少85公里。
專家說：“那裡已經沒有什葉派武裝，最多可能還留下了軍隊的顧問。沒有重型裝備，也沒有能對以色列構成威脅的武器。這個問題是我國與伊朗方面解決的。”
瑙姆金提醒說，俄羅斯在巴以衝突問題上一向也考慮到以色列的立場和利益。
他指出：“沒有得到感謝，我們今天反而遇到以色列飛機躲在毫無保護的俄羅斯偵察機後面這種陰險舉動。而且敘利亞近年來都沒有攻擊過以色列，沒有過任何暴力行為。”
瑙姆金表示，由於以色列不急於道歉，繼續堅持自己的說法，這件事還沒有結束。他認為，以方將繼續派代表團密集訪俄並舉行會談。