特朗普29日發推特表示："穆勒會不會在某個時候報告，針對特朗普總統的情況存在利益衝突，包括如下事實，我們曾有非常不愉快和長期的業務關係，我沒有讓他成為美國聯邦調查局的局長（任命特別檢察官前一天），以及特朗普解雇的前聯邦調查局局長科米是他的好朋友？"
共和黨的特朗普還質疑，為甚麼穆勒在挑選自己團隊時只選擇民主黨的代表，其中一部分是為希拉里工作過的，一部分是為奧巴馬工作過的。
調查俄羅斯在美國大選中的"干涉"，以及被白宮和克宮都否認了的特朗普與俄羅斯之間聯繫的工作，由穆勒和國會兩院領導。儘管"調查"已經持續了一年多，但沒有任何"干預"的證據。