據教輔公眾號介紹，這套教輔系列基於大數據分析，策劃了旨在使男女生發揮各自優勢、幫助男女生根據實際情況找出數學學習的薄弱環節、為學習進步找到突破口。
雖然文章指出，男女生兩版的總體難度差不多，只是部分章節內容有差異，但文章里卻引用了一位家長的話：“我九歲的女兒居然是數論代數方面弱一些，幾何部分無比強悍，和男生一樣！也就是說該買藍色版嗎？”這種表達似乎是指，因為男生學習數學的能力強於女生，所以“藍版”教輔難度較高。
肖龍海教授在採訪中指出，這種做法沒有理論根據，是愚弄學生、家長和市場的做法，目的是為了給教輔找到賣點。
“人們學數學只有學的快還是學的慢，基礎好還是基礎弱，有興趣還是沒興趣等這樣的一些差異，顯著的性別差異是沒有的。他們宣稱的大數據，我覺得就是一個噱頭。”
肖龍海還表示，正確使用大數據的做法應該是以學習能力、感興趣程度為標準，而且要根據知識點進行細緻分析。
“數據應該研究出來哪一個單元的哪一個知識點，女生會出現哪些典型錯誤，而男生會出現哪些典型錯誤？而且要瞭解他們為甚麼會出現這些錯誤？要按照學習比較好的、比較中等的、比較後進的，以及對數學有興趣和沒興趣的等這些標準進行分析才有價值，這才是大數據真正的意義，而不是去把它分成男生版本和女生版本。這樣做其實是在矮化和弱智化學生以及市場。”
網友們對男女生兩版數學教輔表達出了反感，並直接指出，這樣做涉及性別歧視。
微博博主“花雪森”說：“覺得女生學不好理科，男生學不好文科是一種偏見。”
微博博主“一個莫得感情的讀書打卡號”說：“思維邏輯有區別那可以有意識地引導孩子揚長補短，在他們各自更擅長的領域出彩，沒必要在數學這一個基礎學科里強行區分。難道下一步準備在中高考的時候也整一個數學卷藍版和紅版？？”
微博博主“DY-Daaaaaa”說：“如果有過一些心理學基礎應該知道，男女的認知差異並不主要體現在水平上。”
華東師範大學出版社官方微博8月19日發佈聲明稱，《男生女生學數學》因引起爭議，現決定，該套書即日起終止出版，不再發行
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