這35人涉嫌洩露國家安全文件罪,以及向卡塔爾洩露軍事情報和軍事財政預算狀況等罪名。此外,這些罪犯還被指控犯間諜罪和叛國罪,並和巴勒斯坦“哈馬斯”(巴勒斯坦伊斯蘭抵抗運動)組織,黎巴嫩什葉派“真主黨”組織,伊朗“伊斯蘭革命衛隊”等組織合作,並向其他國家洩露埃及軍事國防秘密。正是因為這些指控,穆罕默德•穆爾西才面臨死刑。
穆爾西於2013年7月3日遭到數以百萬計的要求其下台的申訴,並被軍方趕下台,在此一年後,即2014年9月,他被移交法庭處理。
此外,4月21日將進行對關於這位前總統涉嫌煽動殺害反動派代表的審判,事件指向2012年12月曾在總統府發生的流血衝突。